ミトコンドリア内にあるDNAを核内にあるDNAと区別してこう呼ぶ。完全な母系遺伝をする為に個体の識別にも良く用いられ、イブ仮説の根拠となっているのはこのmtDNAの情報を元としている。これは卵子内には母系のミトコンドリアが含まれるの対して精子のミトコンドリアは尾部に含まれ、受精の際には切り離され内部に含まれないことに由来する。このDNAの存在はマーギット・ナスにより報告された。
核酸・酵素
エム-ティー-ディー-エヌ-エー
mtDNA
mitochondrial DNA